西暦４世紀の後半。邪馬台国はすでになく、小国が分立し、大和朝廷が姿を現し始める前、朝鮮半島に百済、新羅、高句麗が出現した頃。
南九州で津波などの天災が頻発する。小舟で漁に出ていた磯良たち４人の若者は海底火山の爆発による津波で村を失う。そこで謎の少年（海童、ミケツ）に出会う。磯良たちは水道を抜けた隣の村で赤女に出会う。どこからかミケツが現れ、動かなかった海底の石神が引き上がり、魚群が押し寄せるが、大津波が襲い、赤女の村は壊滅。磯良たちはさらに岬を越えて内海（不知火の海＝有明海）に入る。そこには漁師の後家オオタラシが巫女となっていた。そこに三たびミケツが出現。そこに隼人族が襲う。
この戦いの最中、浜子は隼人族の仲間になり、不知火の海を北上し、佐嘉の川を遡る、そこには世田姫を崇める。
一方、磯良は遥か西方のみみらくの浜（五島列島）に流れ着き、クズナと鮎女に助けられる。３人は末羅、伊都とミケツらを追う。伊都にたどり着いたミケツらは、伊都の王、五十迹手（いとで）から雷の山にいる日矛の女神に誓約するよう言われる。そこで巫女に雷が落ち、天の逆矛をオオタラシに授ける。 末羅には百済の将軍、木羅斤資（もくらこんし）が。伊都の海人らを再び隼人族が襲う。そこに七枝刀を持つミケツと百済将軍を乗せた息長（おさなが）の大船が。 ミケツらは奴の津へ 岡の国の巫女ツブラ媛を打ち破り、いよいよ穴門へ。浜子は速鞆の瀬戸を無事に通過して潮満珠の島に流れ着き、そこで豊玉のトモに出会う。 磯良は巨大なハンマーヘッドシャーク、サイモチの神、潮満珠と潮干珠を狙う隼人族。
穴門の大男、武振熊は、ミケツに大船を建造して献上する。
（登場人物）
磯良（いそら）：主人公
浜子（はまこ）：磯良の仲間
男狭磯（おさし）：磯良の仲間
荒雄（あらお）：磯良の仲間
ミケツ：謎の子供、海童（わたつみ）、客人神（まれびとがみ）
アドベのイソラ：ミケツの守護者
赤女（あかめ）：磯良の恋人になったが・・・。
オオタラシ：巫女、海人の後家、ミケツの保護者となる。
隼人：部族名らしい
さ鹿文（さかや）／厚鹿文（あつかや）
鮎女（あゆめ）：クズナとワニ（サメのこと）の子
クズナ：鮎女の母
追加項目：光文社