★科学技術・学術審議会（旧航空・電子等技術審議会、海洋開発審議会、資源調査会、技術士審議会、学術審議会、測地学審議会を統合）＞研究計画・評価分科会（ライフサイエンス、情報科学技術、地球環境科学技術、ナノテクノロジー・材料、防災分野）／海洋開発分科会／測地分科会／地震調査研究推進本部
★(独)海洋研究開発機構(JAMSTEC。旧海洋科学技術センター)＞横浜研究所＞地球フロンティア／地球観測フロンティア研究システム（気候変動、水循環、地球温暖化、大気組成、生態系、モデル統合化）／国際太平洋研究センター(IPRC)／国際北極圏研究センター(IARC)／固体地球統合フロンティア#(IFREE。海底下深部構造フロンティアの発展改組）／極限環境生物フロンティア（DeepStar/SUGAR）／地球シミュレータセンター
★(財)高度情報科学技術研究機構(RIST、(財)原子力データセンター(NEDAC)が前身)
★(財)地球科学技術総合推進機構(AESTO、アエストと読む)
★(財)日本海洋科学振興財団（MSF、日高海洋科学振興財団の改組。C-14測定、海洋モニタリング、むつ海洋研究所とむつ科学技術館の運営）／(社)国際海洋科学技術協会（JIMSTEF、文部科学省、農林水産省、通商産業省、運輸省、建設省の5省庁共管、ECOR事務局）
★(独)宇宙航空研究開発機構(JAXA、旧NASDA／NAL／ISAS)＞地球観測利用研究センター(EORC)／(財)リモート・センシング技術センター(RESTEC)
★(独)防災科学技術研究所(NIED)（干ばつ／大雨予測、雪害、地震）＞強振ネットワークK-NET（強震観測管理室）＞(財)地震予知総合研究振興会（ADEP）
★大学共同利用機関法人情報・システム研究機構＞国立極地研究所(NIPR)／国立情報学研究所（Nii、旧文部省学術情報センター、NACSIS、図書館目録、研究活動資源、研究者公募情報、情報検索、電子図書館、学会リンク集）
★大学共同利用機関法人人間文化研究機構＞総合地球環境学研究所（RIHN、京都）
★(独)物質・材料研究機構
★(財)高輝度光科学研究センター（JASRI）＞Spring-8(原研と理研が建設)
★高エネルギー加速器研究機構＞物質構造科学研究所＞放射光研究施設（フォトン・ファクトリー、筑波）
★(独)日本学術振興会ホームページ＞科学研究費補助金ホームページ／特別研究員
★国立天文台＞理論天文学研究系